Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms