Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms