Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms