Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme1P97371 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme1P97371 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme1P97371 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme1P97371 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms