Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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