Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
RhodP97348 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RhodP97348 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RhodP97348 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RhodP97348 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RhodP97348 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
RhodP97348 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RhodP97348 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RhodP97348 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RhodP97348 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RhodP97348 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RhodP97348 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RhodP97348 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RhodP97348 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RhodP97348 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RhodP97348 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RhodP97348 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RhodP97348 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RhodP97348 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RhodP97348 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RhodP97348 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RhodP97348 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RhodP97348 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RhodP97348 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RhodP97348 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RhodP97348 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RhodP97348 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RhodP97348 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RhodP97348 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RhodP97348 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RhodP97348 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RhodP97348 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RhodP97348 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RhodP97348 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RhodP97348 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RhodP97348 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RhodP97348 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
RhodP97348 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RhodP97348 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RhodP97348 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RhodP97348 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RhodP97348 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RhodP97348 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RhodP97348 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RhodP97348 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RhodP97348 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RhodP97348 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms