Protein–RNA interactions for Protein: P81269

Atf1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf1P81269 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf1P81269 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf1P81269 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf1P81269 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf1P81269 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf1P81269 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atf1P81269 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atf1P81269 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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