Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx2P81066 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx2P81066 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx2P81066 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Acmsd-201ENSMUST00000038006 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx2P81066 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Habp2-202ENSMUST00000095948 2815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Slc23a1-201ENSMUST00000025212 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Cpt1b-201ENSMUST00000109313 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 AC165080.1-201ENSMUST00000215257 3123 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Slco5a1-205ENSMUST00000146763 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Tnip1-205ENSMUST00000108886 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx2P81066 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Mgme1-201ENSMUST00000028910 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx2P81066 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx2P81066 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx2P81066 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Wdr78-201ENSMUST00000036451 3671 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx2P81066 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Slc34a2-201ENSMUST00000094787 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx2P81066 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx2P81066 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms