Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SbdsP70122 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms