Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms