Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms