Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.7 ms