Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppfia3P60469 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms