Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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