Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpbP50405 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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SftpbP50405 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpbP50405 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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SftpbP50405 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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SftpbP50405 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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SftpbP50405 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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SftpbP50405 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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SftpbP50405 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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SftpbP50405 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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SftpbP50405 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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SftpbP50405 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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SftpbP50405 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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SftpbP50405 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpbP50405 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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SftpbP50405 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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