Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VdrP48281 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VdrP48281 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.7 ms