Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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