Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
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Gli1P47806 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gli1P47806 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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