Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms