Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Xrcc5P27641 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc5P27641 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.8 ms