Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms