Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
U2af2P26369 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
U2af2P26369 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
U2af2P26369 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
U2af2P26369 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
U2af2P26369 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
U2af2P26369 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
U2af2P26369 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
U2af2P26369 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
U2af2P26369 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
U2af2P26369 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms