Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms