Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P20040 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P20040 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P20040 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P20040 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P20040 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P20040 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P20040 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P20040 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P20040 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P20040 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P20040 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P20040 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P20040 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P20040 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P20040 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P20040 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P20040 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P20040 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P20040 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P20040 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P20040 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P20040 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P20040 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P20040 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P20040 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P20040 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P20040 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P20040 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P20040 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P20040 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P20040 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P20040 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P20040 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P20040 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P20040 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P20040 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P20040 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P20040 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P20040 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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