Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnnc1P19123 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms