Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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