Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srp54P14576 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srp54P14576 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp54P14576 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Srp54P14576 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Srp54P14576 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Srp54P14576 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Srp54P14576 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Srp54P14576 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Srp54P14576 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Srp54P14576 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp54P14576 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp54P14576 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp54P14576 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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