Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl2P10148 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms