Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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H2-Eb1P04230 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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H2-Eb1P04230 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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H2-Eb1P04230 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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H2-Eb1P04230 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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H2-Eb1P04230 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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H2-Eb1P04230 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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H2-Eb1P04230 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
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