Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
GzmbP04187 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GzmbP04187 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GzmbP04187 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms