Protein–RNA interactions for Protein: P01804

Ig heavy chain V-III region HPC76 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01804 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01804 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01804 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01804 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01804 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01804 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01804 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01804 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01804 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01804 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01804 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01804 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01804 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01804 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01804 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01804 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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P01804 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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P01804 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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P01804 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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