Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01638 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01638 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01638 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01638 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01638 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01638 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01638 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01638 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01638 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01638 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01638 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01638 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01638 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01638 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01638 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01638 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01638 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01638 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01638 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
P01638 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01638 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01638 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01638 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01638 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01638 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01638 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01638 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01638 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01638 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01638 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01638 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01638 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01638 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01638 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01638 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01638 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01638 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01638 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01638 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01638 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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