Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

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Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Vamp4O70480 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Vamp4O70480 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Vamp4O70480 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Vamp4O70480 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Vamp4O70480 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Vamp4O70480 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Vamp4O70480 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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