Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms