Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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