Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms