Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms