Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm5225J3QPL3 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm5225J3QPL3 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm5225J3QPL3 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5225J3QPL3 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms