Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gm21976J3QNN2 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gm21976J3QNN2 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gm21976J3QNN2 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm21976J3QNN2 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm21976J3QNN2 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm21976J3QNN2 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm21976J3QNN2 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm21976J3QNN2 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm21976J3QNN2 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm21976J3QNN2 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm21976J3QNN2 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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