Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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Taf4bG5E8Z2 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Taf4bG5E8Z2 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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