Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms