Protein–RNA interactions for Protein: F8VQG7

N4bp2, NEDD4-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp2F8VQG7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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N4bp2F8VQG7 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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N4bp2F8VQG7 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
N4bp2F8VQG7 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms