Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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H2-M1F7CXU4 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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H2-M1F7CXU4 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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H2-M1F7CXU4 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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H2-M1F7CXU4 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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H2-M1F7CXU4 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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