Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms