Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Tnc-204ENSMUST00000107377 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Igkv1-99F6XWB2 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms