Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933403O08RikF6UK53 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms