Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms