Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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