Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518aB2RRF6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms