Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zbed5B2RPU8 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms